國立陽明交通大學牙醫學院，包含「牙醫學系」、「口腔生物研究所」及「口腔組織工程暨生技材料研究所」。「牙醫學系」於民國65 年設立，81 年8 月成立「臨床牙醫學研究所」碩士班，民國89 年9 月開始招收博士班學生，95 學年度配合學校政策，系所合併為一個單位，自此牙醫學系包含學士班、碩士班及博士班之一貫學制，使牙醫教育體系，更臻完備。牙醫學系以推動牙醫教改與實證訓練，建立卓越國際口腔醫學研究、培養術德兼優之口腔醫學專業人才為目標。迄今培育出無數牙醫師及牙醫師資，其中更有優秀校友為國內外牙醫重鎮之領導人才及科技精英。
「口腔生物研究所」碩士班成立於民國82 年，民國91 年成立博士班。口腔生物學為生物醫學之一支，主要針對口腔內外及周圍組織結構之特性而從事各種生命現象之研究。所招收的學生，包含醫、牙、理、農、工等相關領域學系的畢業生，主要利用先進之生物醫學科技，以基礎科學之研究方法，為臨床及基礎研究所面臨之問題，尋求解決之道，迄今為國家培育無數大學教師及科研人才。
「口腔組織工程暨生技材料研究所」碩士班成立於民國111年，研究領域涵蓋口腔組織工程、光學同調斷層掃描、植體表面處理技術、3D列印材料研發、AR/VR/MR/XR應用、牙科大數據與統計分析、牙科認知科學與咀嚼吞嚥評估等。是一個以產業連結、推動創業為基礎的研究所，致力於推動台灣本土牙材產業升級，期能開發出具有創新性與競爭力的新式牙材與診斷技術。
牙醫學院三個單位各具特色，在空間上共同使用牙醫館，在師資上則互相支援，更與本校附設醫院，北、中、高三個榮總等教學醫院，在教學、研究及臨床上相互支援，與日俱進，成為牙醫學院缺一不可之生命共同體。此外，於民國112年5月24日校務會議核定通過，成立校級研究中心：「口腔醫學研發創新中心」，兼具口腔醫學教育學術與創新研發，以整合跨校區之研究量能，並爭取更多資源。
牙醫學院致力於為國家培養德術兼備，有理想、有抱負、有視野、更卓越的優質醫學專業人才及科研人才，結合跨領域科技，發展全方位之科研與應用，具體落實於醫療照護、產學應用、人才培育、與國際交流等面向，以推動口腔醫學的永續發展至國際一流的地位為目標邁進。
